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產(chǎn)品詳情
簡單介紹:
miRNA功能預測的數(shù)據(jù)分析 :上海達為科生物,主營實驗技術服務,如想了解更多miRNA功能預測的數(shù)據(jù)分析內(nèi)容,歡迎來電咨詢!
詳情介紹:
達為科優(yōu)勢
- 系統(tǒng)直觀地得到核心調(diào)控microRNA得到受多個microRNA調(diào)控的重要靶基因
原理
miRNA與對應的靶基因存在負調(diào)控關系,因此可以將表達譜分析得到的差異基因與miRNA靶基因取交集后對miRNA做負相關分析,在構建靶基因之間的調(diào)控關系網(wǎng)絡后,加入對應miRNA對靶基因的調(diào)控關系,從而方便地研究miRNA對整個靶基因信號轉導流程的轉錄后調(diào)控過程。
服務流程
- 篩選差異基因。
- 通過TargetScan的方法預測MicroRNA的靶基因,得到差異MicroRNA能夠調(diào)控的靶基因。
- 根據(jù)差異基因和差異MicroRNA的數(shù)據(jù)作MicroRNA-mRNA的負相關分析,得到和差異MicroRNA表達趨勢相反的靶基因。
- 對上一步得到的靶基因進行功能分析,得到可靠的、顯著性的、靶向的基因功能。
- 根據(jù)靶基因功能的分析結果,構建基因功能之間相互作用的網(wǎng)絡。(GO-Map)
- 對靶基因進行顯著性信號通路分析,得到靶基因參與的準確的、可靠的、顯著的信號通路。(Pathway-Analysis)
- 根據(jù)顯著性信號通路的分析結果,構建顯著性信號通路的網(wǎng)絡,從中發(fā)現(xiàn)上游信號通路、中樞信號通路和下游效應信號通路。(Path-Net)
- 對顯著性功能結果和顯著性信號通路結果中包含的靶基因取交集,得到交集靶基因。
- 根據(jù)MicroRNA-靶基因的關系,構建MicroRNA調(diào)控交集靶基因的網(wǎng)絡,從中發(fā)現(xiàn)調(diào)控能力強的MicroRNA以及被調(diào)控的多的靶基因。(MicroRNA-Gene-Net)
- 基于靶基因的顯著性功能分析,構建MicroRNA與交集靶基因功能的網(wǎng)絡,從中發(fā)現(xiàn)調(diào)控能力強的MicroRNA和受調(diào)控多的基因功能。(MicroRNA-GO-Network)

服務流程
步驟 |
客戶提供
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服務內(nèi)容
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諾百提供
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1 | 1、目的miRNA信息;2、靶細胞及相關信息;靶蛋白抗體(如果需要)及其他生物學功能分析相關信息及材料 | 設計、合成Pre-miR miRNA模擬物或miRNA抑制劑 |
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2 |
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(方案一)質(zhì)粒構建,轉染細胞。 | 質(zhì)粒測序報告 |
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(方案二)慢病毒包裝,侵染細胞 | 慢病毒液(1E6 – 1E7 TU/ml);病毒滴度數(shù)據(jù) | |
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(方案三)腺病毒包裝,侵染細胞 | 腺病毒液(1E8 – 1E9 pfu/ml);病毒滴度數(shù)據(jù) | |
3 |
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TaqMan探針檢測靶基因表達水平的變化 | 檢測報告 |
4 | 可用的靶蛋白抗體 | 免疫學方法檢測靶蛋白表達水平的變化 | 檢測報告 |