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LncRNA(Long non-coding RNA),即長鏈非編碼RNA,是一類長度超過200個核苷酸的非編碼RNA分子。盡管它們不直接編碼蛋白質(zhì),但在多種層面上(如表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)對蛋白編碼基因起調(diào)控作用1。近年來,隨著研究的深入,LncRNA的分子機制逐漸得到揭示。
首先,LncRNA在細胞中具有多種功能。它們可以參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控以及染色體沉默、基因組印記、染色質(zhì)修飾等多種重要的調(diào)控過程。例如,某些LncRNA能夠招募染色質(zhì)重構(gòu)和修飾復合體到特定位點,改變DNA/RNA甲基化狀態(tài)、染色體結(jié)構(gòu)和修飾狀態(tài),進而控制相關(guān)基因的表達。
其次,LncRNA的功能機制多種多樣。它們可以作為RNA誘餌,結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子,干擾其與基因promoter區(qū)域的結(jié)合,從而調(diào)控轉(zhuǎn)錄;也可以作為分子海綿,吸附miRNA,抑制其與mRNA的結(jié)合,使得mRNA免于降解;此外,LncRNA還可以作為蛋白互作的支架或橋梁,影響蛋白多聚物的形成,調(diào)控蛋白活性;或者招募染色質(zhì)修飾因子,改變?nèi)旧w的修飾水平,從而影響基因的轉(zhuǎn)錄和表達。
在研究方法上,針對LncRNA的分子機制研究,可以采用多種技術(shù)。例如,通過芯片或RNA測序等方法對疾病模型和對照樣本組織進行LncRNA表達譜分析,從而篩選出具有表達差異的LncRNA;然后,通過PCR或Northern Blot技術(shù)對候選LncRNA進行驗證,確定其表達差異;進一步,還可以利用熒光原位雜交技術(shù)(FISH)或RNA Scope技術(shù)等確定LncRNA在細胞中的定位,以便更好地理解其功能。
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