智啟醫(yī)學(xué)新維度
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一、基本原理
Western Blot 通過(guò)電泳將蛋白質(zhì)分離,然后將分離后的蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到固相載體(如硝酸纖維素膜或 PVDF 膜)上。接著,利用特異性抗體與目的蛋白結(jié)合,再通過(guò)標(biāo)記的二抗進(jìn)行檢測(cè),以確定目的蛋白的存在、大小和相對(duì)豐度。
二、主要步驟
- 提蛋白:取根據(jù)分組給藥處理48h過(guò)的六孔板中的細(xì)胞,將6孔板中上清用移液器棄掉,每孔用1ml 1×PBS潤(rùn)洗2次,吸凈孔中液體,用0.5毫升的胰酶消化,室溫條件下一分鐘作用。終止消化后將細(xì)胞吹下來(lái),盡量不要產(chǎn)生氣泡。
- 轉(zhuǎn)移到EP管中,做上標(biāo)記并配平后,1000rpm,5min,保留細(xì)胞沉淀,每管加入150μl細(xì)胞裂解液(100μl ripa+1μl pmsf,需提前從-20℃冰箱拿出化凍),吹打混勻。置于冰上裂解半小時(shí),放入-80℃冰箱,凍融3次,打開(kāi)高速低溫離心機(jī),溫度降低到4℃才可以使用,離心機(jī)14000轉(zhuǎn)離心30min(高速離心機(jī)使用時(shí)一定要配平)。用10μl移液器小心吸取上清,不要沉淀。
- BCA定量:
(1) 首先,需要準(zhǔn)備標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液。我們移液器吸取15微升的標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液(濃度為10mg/ml)到EP管中,然后再添加285μl的生理鹽水,從而得到濃度為0.5mg/ml的標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液。接著,按照表4中預(yù)先設(shè)計(jì)好的濃度梯度,配置8管不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液。
表 標(biāo)準(zhǔn)蛋白梯度濃度配制
蛋白濃度(mg/ml) |
0 |
0.025 |
0.05 |
0.1 |
0.2 |
0.3 |
0.4 |
0.5 |
生理鹽水(μl) |
80 |
76 |
72 |
64 |
48 |
32 |
16 |
0 |
0.5mg/ml的標(biāo)準(zhǔn)蛋白(μl) |
0 |
4 |
8 |
16 |
32 |
48 |
64 |
80 |
(2) 接下來(lái),對(duì)蛋白樣品進(jìn)行稀釋。我們?nèi)?2μl的生理鹽水到EP管中,做好標(biāo)記,再加入8微升的蛋白樣品,將其混勻,相當(dāng)于稀釋10倍。這一步的目的是使樣品的濃度范圍與標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液的濃度范圍相匹配,以便后續(xù)進(jìn)行比較和分析。
(3) 按照分組,每組三個(gè)復(fù)孔,每孔20微升樣品和200μl的AB液混合液。
(4) 隨后,將96孔板板蓋拿掉后放入酶標(biāo)儀中,在37攝氏度條件下間隔振蕩30分鐘。這一步的目的是讓AB液與蛋白質(zhì)發(fā)生反應(yīng),形成有色化合物,其顏色深淺與蛋白質(zhì)的濃度成正比。
(5) *后,測(cè)量每個(gè)孔的吸光度值,然后分析數(shù)據(jù)。
(6) 根據(jù)BCA定量的結(jié)果調(diào)整樣品蛋白的濃度,使各組的濃度相同,用ripa作為稀釋液稀釋,再加入等同于蛋白溶液體積1/4的5×loading buffer,用渦旋混勻器混勻后,在電磁爐中水浴100℃ 15min,降到室溫后放入-80℃冰箱中保存。
- 制膠:用去離子水將玻璃板沖洗干凈,晾干后裝配到夾板上。用超純水檢漏,確定不漏后棄去板縫中的超純水,用濾紙吸干。根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求,按照配方配制10%的分離膠,配置過(guò)程中需注意AP*后加,并且要快速地混勻;混勻后用移液器沿著板縫邊緣緩緩加入7ml分離膠,盡量不要產(chǎn)生氣泡,加完后,沿板縫上方來(lái)回移動(dòng)緩慢加入1ml異丙醇。靜置25分鐘左右分離膠就會(huì)凝固。將異丙醇倒掉,用濾紙吸附殘余的異丙醇。將1.5mm、10孔規(guī)格的梳子用純水洗干凈,插入板縫中間。按照配方配置5%的濃縮膠,混勻后用移液器抵著梳子和玻璃板邊緣之間的縫隙加入,移液器中液體不要打完,避免產(chǎn)生氣泡。加滿后室溫靜置至完全凝固(25min左右)。
- 上樣:將蛋白樣品、Marker以及1×loading buffer取出置于冰上化凍,因?yàn)榈鞍踪|(zhì)容易降解,所以必須要放到冰上化凍。將制好的膠放入電泳槽中,量取30ml的10×電泳液用純水稀釋到300ml,得到1×電泳液,在板中間加電泳液,直到溢出到槽中。拔掉梳子,按照順序?qū)悠沸⌒亩志徛丶尤氲侥z孔內(nèi),剩下的孔用1×loading buffer補(bǔ)齊,防止樣品飄逸。
- 電泳:將電泳盒的蓋子蓋好,注意電極的正負(fù),設(shè)置恒壓80v,開(kāi)始后電泳盒中有小氣泡產(chǎn)生,則說(shuō)明有電流回路。大約四五十分鐘后,觀察Marker的位置,若Marker已完全分開(kāi),則將電壓改為恒壓120v,繼續(xù)電泳直至loading跑至分離膠底部時(shí)關(guān)閉電泳儀。
- 轉(zhuǎn)膜:在塑料槽中倒入一定量的甲醇,將所需的PVDF膜用簽字筆寫(xiě)上相關(guān)信息做好標(biāo)記,將膜浸入甲醇中浸泡,將其激活,使其更易與蛋白質(zhì)結(jié)合。將轉(zhuǎn)膜夾和兩個(gè)海綿墊用純水洗凈后放入盒中(轉(zhuǎn)膜夾黑面在下),加入轉(zhuǎn)移液直至浸沒(méi)海綿,取3層濾紙浸潤(rùn)轉(zhuǎn)移液后放于轉(zhuǎn)膜夾黑面上,用玻璃管趕去氣泡,將膠取出(膠體有毒,要戴手套操作),切除濃縮膠和多余的分離膠(丟棄到垃圾桶里,不能放到洗手池中,防止堵塞下水道),將分離膠倒置于濾紙上,放PVDF膜,放三層濾紙,每步操作之后都需要趕走夾層中的氣體(殘留的氣體會(huì)影響到轉(zhuǎn)膜的效果)。轉(zhuǎn)膜夾夾好,放入槽中,將轉(zhuǎn)移液倒?jié)M槽。將電泳盒放入盆中,加冰,保證電泳盒周圍被冰塊圍繞,再加入一定量的水,蓋上蓋子,設(shè)置電流160mA恒流,轉(zhuǎn)膜3h后,停止轉(zhuǎn)膜,關(guān)閉電泳儀。
- 封閉:將轉(zhuǎn)膜得到的PVDF膜取出,可以觀察到清晰的Marker條帶,放入1×TBST中洗一下。放入封閉液中30分鐘。
- 用加了吐溫的TBS洗PVDF膜8分鐘×3次,再用TBS洗膜8min,清洗完畢后,取一泡沫板,放上干凈的一次性塑料手套,再放上膜,用濾紙吸干水分,根據(jù)所需孵育一抗的分子量,用鋒利的刀將膜裁開(kāi),標(biāo)記上所孵育的蛋白,放入提前配置好的一抗中4℃孵育,孵育20h。
- 孵育20h后將膜取出,TBST洗膜8min×3次,在*后一遍時(shí)根據(jù)一抗的種類配置二抗。將洗好的膜放入二抗溶液中,4攝氏度2h。TBST洗膜8分鐘×3次,TBS洗8min。
- 打開(kāi)顯影儀,配置顯影液。用濾紙將顯影板擦干凈,夾取需要顯影的膜到顯影板上,不要產(chǎn)生氣泡,滴加顯影液,放入顯影儀中顯現(xiàn)結(jié)果,拍照記錄,根據(jù)需要調(diào)整圖片,得到清晰的條帶,修改圖片名稱,做好記錄。重復(fù)上述操作給其他的PVDF膜顯影。結(jié)束后將圖片保存到自己的優(yōu)盤(pán)里。
三、應(yīng)用領(lǐng)域
1. 蛋白質(zhì)表達(dá)分析:檢測(cè)特定蛋白質(zhì)在不同組織、細(xì)胞或不同處理?xiàng)l件下的表達(dá)水平變化。
2. 蛋白質(zhì)定位研究:確定蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的定位。
3. 蛋白質(zhì)相互作用研究:通過(guò)共免疫沉淀結(jié)合 Western Blot 檢測(cè)蛋白質(zhì)之間的相互作用。
4. 疾病診斷和研究:在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,用于檢測(cè)疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的表達(dá)變化,為疾病的診斷和研究提供依據(jù)。
四、實(shí)驗(yàn)服務(wù)
分子實(shí)驗(yàn)平臺(tái):高效運(yùn)作了qRT-PCR、Western blot、雙向電泳技術(shù)、分子克隆與質(zhì)粒構(gòu)建、流式細(xì)胞儀檢測(cè)、免疫共沉淀、染色質(zhì)免疫共沉淀、RNA免疫沉淀、凝膠電泳遷移實(shí)驗(yàn)、酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定、外泌體抽提及鑒定等實(shí)驗(yàn)。
基因組學(xué)平臺(tái):可以完成甲基化檢測(cè)、基因芯片分析、高通量測(cè)序等實(shí)驗(yàn)。
蛋白組學(xué)平臺(tái):能實(shí)現(xiàn)LC-MS、ITRAQ、蛋白質(zhì)修飾分析等重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目。
病理學(xué)平臺(tái):涉及免疫熒光染色、免疫組織化學(xué)染色、HE染色、特殊染色等實(shí)驗(yàn)。
生物信息學(xué)分析:文本挖掘,芯片表達(dá)譜分析,序列分析,轉(zhuǎn)錄因子靶點(diǎn)預(yù)測(cè),高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析等項(xiàng)目
臨床前CRO服務(wù):主要提供呼吸系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)性疾病的藥效學(xué)評(píng)價(jià)服務(wù),包括靶點(diǎn)驗(yàn)證、體內(nèi)外模型的構(gòu)建、藥物篩選、藥物分析、藥效性評(píng)價(jià)、藥代動(dòng)力學(xué)和藥理學(xué)研究以及院內(nèi)制劑研發(fā)等。
項(xiàng)目轉(zhuǎn)化服務(wù):助力客戶進(jìn)行方案設(shè)計(jì)、聯(lián)合課題申報(bào)、藥物項(xiàng)目引進(jìn)和孵化,解決客戶對(duì)實(shí)驗(yàn)技術(shù)平臺(tái)、專業(yè)人才、zhuanli申請(qǐng)和融資的需求;
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