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上海交大課題組研究腫瘤精準(zhǔn)識(shí)別獲新靶標(biāo)成果

日期:2025-05-01 22:13
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摘要: 有名學(xué)術(shù)雜志American Journal of Human Genetics(AJHG, IF=10.794)2017年期在線發(fā)表了上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院細(xì)胞分化與凋亡重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張健課題組在變構(gòu)領(lǐng)域的成果Proteome-scale investigation of protein allosteric regulation perturbed by somatic mutations in 7,000 cancer genomes,報(bào)告其發(fā)展了通過大規(guī)模腫瘤基因組在蛋白結(jié)構(gòu)上的變構(gòu)映射精準(zhǔn)識(shí)別各類型腫瘤全新靶標(biāo)的方法,并利用該方法發(fā)現(xiàn)非小細(xì)胞肺癌的全新靶標(biāo)PDE10A。 隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展,識(shí)別各種腫瘤亞型所特有的...


有名學(xué)術(shù)雜志American Journal of Human GeneticsAJHG, IF=10.7942017年期在線發(fā)表了上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院細(xì)胞分化與凋亡重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張健課題組在變構(gòu)領(lǐng)域的成果Proteome-scale investigation of protein allosteric regulation perturbed by somatic mutations in 7,000 cancer genomes,報(bào)告其發(fā)展了通過大規(guī)模腫瘤基因組在蛋白結(jié)構(gòu)上的變構(gòu)映射精準(zhǔn)識(shí)別各類型腫瘤全新靶標(biāo)的方法,并利用該方法發(fā)現(xiàn)非小細(xì)胞肺癌的全新靶標(biāo)PDE10A。


隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展,識(shí)別各種腫瘤亞型所特有的新靶標(biāo)已經(jīng)成為靶向藥物開發(fā)的重要前提。隨著臨床大量各類腫瘤病人基因組數(shù)據(jù)的不斷累積,解析腫瘤基因組高內(nèi)涵數(shù)據(jù),識(shí)別與各亞型腫瘤有關(guān)或者驅(qū)動(dòng)腫瘤發(fā)生的基因(Drivergenes)及其表達(dá)蛋白,繼而利用現(xiàn)有藥物或發(fā)展新小分子靶向該蛋白靶標(biāo),為該類型患者提供個(gè)體化**已成為了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代藥物發(fā)現(xiàn)的新趨勢(shì)。


變構(gòu)(Allostery)指在遠(yuǎn)離蛋白底物位點(diǎn)的變構(gòu)位點(diǎn)(AllostericSite)結(jié)合調(diào)節(jié)小分子,從而調(diào)節(jié)蛋白底物位點(diǎn)功能的現(xiàn)象,是生命體中廣泛存在且十分重要的一種調(diào)節(jié)機(jī)制。在本工作中,張健等解析了33類腫瘤的7000例臨床病人基因組,將識(shí)別的47,000多個(gè)突變數(shù)據(jù)映射至已發(fā)現(xiàn)的蛋白結(jié)構(gòu)上,發(fā)現(xiàn)這些腫瘤基因組樣本中的突變主要富集于蛋白的變構(gòu)位點(diǎn)以及底物位點(diǎn)?;谶@個(gè)現(xiàn)象,他們?cè)O(shè)計(jì)了根據(jù)映射在變構(gòu)位點(diǎn)的突變分布來識(shí)別針對(duì)不同腫瘤新靶標(biāo)的方法AlloDriver。利用這個(gè)方法,他們發(fā)現(xiàn)了非小細(xì)胞肺癌的新靶標(biāo)PDE10A(注:PDE10A是一個(gè)已知的用于**精神類疾病的藥物靶點(diǎn)),并通過化學(xué)生物學(xué)方法證明PDE10A已上市的藥物可以有效殺傷非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株,為非小細(xì)胞肺癌的**提供了新的途徑。


張健課題組自2009年起長期致力于變構(gòu)在藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的研究,課題組先后在變構(gòu)調(diào)節(jié)機(jī)制闡明、變構(gòu)藥物設(shè)計(jì)方法發(fā)展及變構(gòu)小分子發(fā)現(xiàn)方面做出系列工作,以通訊作者在Chem Rev, Chem Soc Rev,Nucleic Acids Res, Bioinformatics, Structure, ACS Med Chem Lett等多個(gè)重要學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表了一系列變構(gòu)研究成果。本的作者為張健課題組的沈倩誠博士以及美國哈佛醫(yī)學(xué)院的程飛雄博士,的共同通訊作者還包括美國范德堡大學(xué)的趙中明教授。此外,上海交通大學(xué)的陳國強(qiáng)教授,華東師范大學(xué)的劉明耀教授以及盧偉強(qiáng)博士對(duì)亦有貢獻(xiàn)。



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