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數(shù)字PCR的原理及應(yīng)用領(lǐng)域
在定量PCR時,我們常常糾結(jié)一個問題,究竟是相對定量還是定量呢?如今,你無需糾結(jié)了,因為數(shù)字PCR(digital PCR)來了。盡管這兩種技術(shù)有些類似,都是估計起始樣品中的核酸量,但它們有一個重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測定核酸量,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),是對起始樣品的定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域:拷貝數(shù)變異、突變檢測、基因相對表達(dá)研究(如等位基因不平衡表達(dá))、二代測序結(jié)果驗證、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等。
數(shù)字PCR是一種核酸分子定量技術(shù)。當(dāng)前核酸分子的定量有三種方法,光度法基于核酸分子的吸光度來定量;實時熒光定量PCR(Real Time PCR)基于Ct值,Ct值就是指可以檢測到熒光值對應(yīng)的循環(huán)數(shù);數(shù)字PCR是的定量技術(shù),基于單分子PCR方法來進(jìn)行計數(shù)的核酸定量,是一種定量的方法。主要采用當(dāng)前分析化學(xué)熱門研究領(lǐng)域的微流控或微滴化方法,將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度。
PCR實際上是一個在模板DNA、引物(模板片段兩端的已知序列)和四種脫氧核苷酸等存在的情況下,DNA聚合酶依賴的酶促合成反應(yīng),擴(kuò)增的特異性取決于引物與模板DNA的特異結(jié)合。
數(shù)字PCR(Digital PCR)儀器應(yīng)用領(lǐng)域:
癌癥生物標(biāo)志物研究和拷貝數(shù)變異分析以**的靈敏度和準(zhǔn)確度測量癌癥突變的變異程度、
檢測稀有的DNA靶拷貝以及解析拷貝數(shù)變異狀態(tài)。
病原體檢測
地對靶DNA或RNA分子中的細(xì)微變化進(jìn)行定量分析,從而檢測和監(jiān)測病原體。
與新一代測序無縫對接
無需使用標(biāo)準(zhǔn)曲線,直接對NGS庫執(zhí)行定量分析。
基因表達(dá)分析
可對少量mRNA和miRNA的細(xì)微變化進(jìn)行準(zhǔn)確及重復(fù)性**的檢測。
環(huán)境監(jiān)測
使用QX200系統(tǒng)可測試多種環(huán)境樣品,例如土壤和水。
食品檢測
采用經(jīng)過驗證的ddPCR方法對轉(zhuǎn)基因生物體(GMO)進(jìn)行評估。