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RT-PCR、QPCR、Real-time PCR、Real-time RT-PCR 如何區(qū)分
將 RT-PCR、Realtime-PCR、QPCR 區(qū)分,并不是輕而易舉的事情。就算選擇實驗外包,自身也要清楚。
什么是 RT-PCR?RT-PCR 就是逆轉(zhuǎn)錄 PCR(reverse transcription PCR)或者稱反轉(zhuǎn)錄 PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的一種廣泛應(yīng)用的變形。在 RT-PCR 中,一條 RNA 鏈被逆轉(zhuǎn)錄成為互補 DNA,再以此為模板通過 PCR 進行 DNA 擴增。
那什么是 qPCR、Real-time-PCR?其實 Rea-time-PCR 和 qPCR(Quantitative Rea-time-PCR)是一碼事,都是實時定量 PCR,指的是 PCR 過程中每個循環(huán)都有數(shù)據(jù)的實時記錄,因此可以對起始模板數(shù)量進行的分析。
雖然 Real-time PCR(實時熒光定量 PCR)和 Reverse transcription PCR(反轉(zhuǎn)錄 PCR)看起來都可以縮寫為 RT-PCR,但是,上的約定俗成的是:RT-PCR 特指反轉(zhuǎn)錄 PCR,而 Real-time PCR 一般縮寫為 qPCR(quantitative real-time PCR)。
那什么是 real-time RT-PCR(或 RT-qPCR)?real-time RT-PCR 中間的「RT」是 reverse transcription(逆轉(zhuǎn)錄),整個意思就是利用 mRNA 或 總 RNA 為模板的實時逆轉(zhuǎn)錄 PCR 技術(shù)(quantitative Real-time RT-PCR)。real time RT-PCR 指的是 qPCR+RT-PCR 的組合,是說將 mRNA 逆轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后再作為模板進行實時熒光 PCR 分析,因為 RT-PCR 是可以定性的,但不能進行定量檢測的。
所以不難理解 real-time RT-PCR(RT-qPCR)就是結(jié)合了熒光定量技術(shù)的反轉(zhuǎn)錄 PCR:先從 RNA 反轉(zhuǎn)錄得到 cDNA(RT),然后再用 Real-time PCR 進行定量分析(qPCR)。所以,實時熒光定量 PCR,它不僅可以用 cDNA 作為模板,也可以用基因組 DNA 等作為模板。