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實驗外包助手 SDS-PAGE凝膠電泳實驗外包
一.實驗外包助手 SDS-PAGE的原理
SDS-Page電泳主要利用聚丙烯酰胺的分子篩效應(yīng)分離蛋白質(zhì)和核酸,SDS-PAG蛋白質(zhì)電泳分析可從蛋白質(zhì)亞基分子量的大小就分離蛋白質(zhì)。
二. SDS-PAGE的種類
1、連續(xù)系統(tǒng):電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同,帶電顆粒在電場作用下,主要靠電荷和分子篩效應(yīng)。
2、不連續(xù)系統(tǒng):緩沖液離子成分、pH、凝膠濃度及電位梯度均不連續(xù)性,帶電顆粒在電場中泳動不僅有電荷效應(yīng),分子篩效應(yīng),還具有濃縮效應(yīng),因而其分離條帶清晰度及分辨率均較前者佳。
三. 實驗外包助手SDS-PAGE實驗操作
1、試劑配制(注意:所用試劑均需分析純)
1)5mol/L三羥甲基氨基甲烷-鹽酸,Tris-HCl,pH: 8.8:稱取181.71g三羥甲基氨基甲烷加適量超純水溶解,用鹽酸調(diào)pH值至8.8,加超純水定容至1000ml。
2)29.2%丙烯酰胺-0.8% N,N’-甲叉雙丙烯酰胺:稱取29.2g丙烯酰胺,0.8g N, N’-甲叉雙丙烯酰胺,加超純水溶解,并定容至100ml,混勻后用濾紙過濾,避光保存。
注意:丙烯酰胺為劇毒試劑,易被皮膚吸收,使用過程中勿必要戴橡膠手套。
3)10%十二烷基硫酸鈉(SDS):稱取1g十二烷基硫酸鈉,加超純水溶解,并定容至10ml,室溫保存。
4)四甲基乙二胺原液(TEMED)
5)10%過硫酸銨:稱取1g過硫酸銨,加10ml超純水溶解。
6)1mol/L三羥甲基氨基甲烷-鹽酸,pH: 6.8:稱取12.114g三羥甲基氨基甲烷(Tris-Base)加適量純化水溶解,用鹽酸調(diào)pH值至6.8,加超純水定容至100ml。
7)10倍電極緩沖液貯液:稱取甘氨酸288.26g,三羥甲基氨基甲烷60.57g,十二烷基硫酸鈉20g,加超純水定容至2L。
8)非還原型2×樣品緩沖液:稱取三羥甲基氨基甲烷3.03g,溴酚藍(lán)0.02g,十二烷基硫酸鈉8g,鹽酸1.89ml,甘油40ml,加超純水溶解并定容至200ml,混勻,分裝小管,2~8℃儲存。
9) 還原型2×樣品緩沖液:稱取三羥甲基氨基甲烷3.03g,溴酚藍(lán)0.02g,十二烷基硫酸鈉8g,鹽酸1.89ml,甘油40ml,加超純水溶解并定容至200ml,再加入β-巰基乙醇40ml,混勻,分裝小管,2~8℃儲存。
10)考馬斯亮藍(lán)染色液:450ml乙醇,450ml純化水,混勻,加入稱好的2.5g考馬斯亮藍(lán)R-250及100ml冰醋酸,放磁力攪拌器上攪拌至少8小時,過濾即得。
11)考馬斯亮藍(lán)脫色液:450ml乙醇,450純化水,混勻,再加100ml冰醋酸,混勻即得。
12)分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白:凍干粉產(chǎn)品按說明書溶解稀釋后,經(jīng)100℃水浴,放冷后分裝于小管中,-20℃保存;液體產(chǎn)品則直接分裝于小管中,-20℃保存,標(biāo)簽上注明使用前需水浴,有效期6個月。
2、實驗外包助手樣品處理
取量待檢樣品按蛋白含量用超純水稀釋至1mg/ml,取稀釋好的樣品與5X樣品緩沖液(20ul+5ul)在一個eppendorf 管中混合。分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白的處理方法按標(biāo)簽說明,如需水浴則同樣品一起100℃加熱5-10min,取上清點樣,
如不需水浴則直接上樣。
3、凝膠配置
制備分離膠:將配好的分離膠灌入電泳槽中,加水覆蓋,室溫下聚合。(室溫不同,聚合時間不同)
凝膠配方如下(兩塊膠):
凝膠種類
分離膠
濃縮膠
凝膠濃度
8%
10%
12%
15%
5%
超純水
6.89ml
5.89ml
4.89ml
3.39ml
3.44ml
30% Acrylamide/Bis Solution
4.0ml
5.0ml
6.0ml
7.5ml
0.83ml
1.0M Tris (pH 6.8)
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0.63ml
1.5M Tris (pH 8.8)
3.8ml
3.8ml
3.8ml
3.8ml
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10% SDS
150μl
150μl
150μl
150μl
50μl
10% APS
150μl
150μl
150μl
150μl
50μl
TEMED
9.0μl
9.0μl
9.0μl
9.0μl
5.0μl
制備濃縮膠
待分離膠聚合后,用濾紙吸去上面的水層,再灌入濃縮膠(配方見上表),插入樣品梳,注意避免氣泡出現(xiàn)。
4、SDS-PAGE電泳
調(diào)膠:拔掉SDS膠上的梳子,并用小針調(diào)整齒的位置(使它們都平行)。
點樣:用20μL的小槍頭,吸煮過的樣品10μL,對準(zhǔn)膠孔點樣,注意不要把樣品點在外面。使用適當(dāng)?shù)姆肿恿康鞍譵arker。
電泳:電泳儀正負(fù)極接好,打開電源。濃縮膠:電壓 low 100V
分離膠:電壓 high 150V。
卸膠:等膠內(nèi)的所有的藍(lán)色都跑出去,電泳停止,一般時間為1-2小時左右。把膠板從電泳儀上卸下,用刀片把膠板撬開,膠的濃縮膠部分割除;
染色:放入考馬斯亮藍(lán)R-250染色液中進(jìn)行常溫過夜染色;
脫色:將過夜染色的SDS-PAGE膠放入脫色液中進(jìn)行脫色,直到背景發(fā)白。
5、數(shù)據(jù)處理:
掃描:將干燥的凝膠放入掃描儀,掃描后計算純度。
純度計算:按峰面積歸一法計算目標(biāo)蛋白的純度。
分子量的計算:以分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白的對數(shù)分子量與其遷移率作標(biāo)準(zhǔn)曲線,代入樣品遷移率計算該樣品的分子量。